浙大双创院理事会是领导机构，理事会设理事长一名，由浙江大学原党委书记，现发展委员会主席金德水担任；设常务副理事长、副理事长、常务理事、特邀常务理事和理事若干名，由学校领导、相关单位负责人、校友代表等组成。